Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA3AQ14563 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms