Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NCBP1Q09161 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NCBP1Q09161 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms