Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN11Q06124 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms