Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PPARDQ03181 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms