Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Tuba4aP68368 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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