Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PTGDSP41222 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms