Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD53P19397 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD53P19397 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD53P19397 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms