Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM3O75382 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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