Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSH5O43196 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSH5O43196 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSH5O43196 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSH5O43196 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MSH5O43196 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC109587.1-213ENST00000610844 652 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MSH5O43196 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 RN7SKP52-201ENST00000516219 250 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSH5O43196 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSH5O43196 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSH5O43196 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MSH5O43196 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC096751.2-201ENST00000507483 792 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms