Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SETD1AO15047 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SETD1AO15047 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms