Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
E2F3O00716 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F3O00716 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms