Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX6Q9UNH7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms