Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCAPERQ9BY12 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms