Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIRT1Q96EB6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIRT1Q96EB6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms