Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RUNDC1Q96C34 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms