Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RNF34Q969K3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms