Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF554Q86TJ5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF554Q86TJ5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms