Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RYR3Q15413 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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