Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms