Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP25P60880 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms