Protein–RNA interactions for Protein: P55089

UCN, Urocortin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCNP55089 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UCNP55089 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UCNP55089 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UCNP55089 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms