Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TTPAP49638 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TTPAP49638 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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