Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMGB2P26583 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms