Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GIMD1P0DJR0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms