Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN6Q9NWW5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms