Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BCL11BQ9C0K0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BCL11BQ9C0K0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms