Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RNF17Q9BXT8 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms