Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RPUSD4Q96CM3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RPUSD4Q96CM3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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