Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFKQ969G6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms