Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CARMIL2Q6F5E8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms