Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM69BQ5VUD6 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM69BQ5VUD6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms