Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AL355860.1-201ENST00000636087 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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MKRN4PQ13434 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MKRN4PQ13434 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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