Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RIPPLY1Q0D2K3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms