Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPOCK1Q08629 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms