Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARFIP1P53367 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms