Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ITGAEP38570 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms