Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA13P31271 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms