Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RLBP1P12271 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms