Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
UBE2J1Q9Y385 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
UBE2J1Q9Y385 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms