Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM35Q9UPQ4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms