Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
STRCQ7RTU9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
STRCQ7RTU9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms