Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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