Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CHD4Q14839 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CHD4Q14839 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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CHD4Q14839 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHD4Q14839 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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