Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RIPPLY1Q0D2K3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms