Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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FAM27E3Q08E93 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM27E3Q08E93 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM27E3Q08E93 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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