Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CYP4F3Q08477 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms