Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LINC00852-201ENST00000475197 1328 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CLDN20-201ENST00000367165 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 THRB-AS1-201ENST00000432368 1216 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC093726.2-201ENST00000609134 679 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CACNB1Q02641 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms