Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FGD1P98174 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD1P98174 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD1P98174 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD1P98174 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD1P98174 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FGD1P98174 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FGD1P98174 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms