Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ACTN1P12814 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms