Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm17078M0QW51 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms